繁华新宿的某条小巷里，有一家小餐馆只在晚上12点到早上7点间营业，因而被称作作“深夜食堂”，食堂里的菜单只有猪肉酱汤套餐一种，但是老板（小林熏饰）可以根据客人的要求利用现有食材做出各种料理。而那些总是忙碌到晚上12点的人，总会到深夜食堂吃饭，他们拖着稍显疲惫的身躯、心事重重而来。形形色色身份不同的人围坐在不甚宽敞的食堂里，你一言我一语，分享彼此的经历与故事。